В декабре 2006 года была образована Московская межрегиональная транспортная прокуратура /объединила транспортные прокуратуры 13 субъектов РФ, входящих в Центральный федеральный округ/, а в конце апреля - Северо- Западная и Южная транспортные прокуратуры.
Как подчеркнули в Генпрокуратуре, новые укрупненные транспортные прокуратуры создаются "в целях совершенствования надзора за исполнением законов на железнодорожном, воздушном и водном транспорте, а также в таможенной сфере". К компетенции 5 новых прокуратур "отнесено осуществление на территории субъектов РФ, входящих в состав Дальневосточного, Сибирского, Приволжского и Уральского федеральных округов, надзора за исполнением законов, соблюдением прав и свобод человека и гражданина в сфере деятельности железнодорожного, воздушного, морского и внутреннего водного транспорта, в таможенной сфере территориальными органами федеральных органов исполнительной власти, субъектов РФ и местного самоуправления, органами внутренних дел на транспорте и таможенными органами, коммерческими и некоммерческими организациями".
Кроме того, они будут осуществлять надзор за уголовно-процессуальной и оперативно-розыскной деятельностью органов внутренних дел на транспорте и таможенных органов, вести предварительное расследование по уголовным делам о преступлениях, совершенных на полотне железной дороги, железнодорожных станциях, вокзалах, платформах, аэродромах, в морских и речных портах, аэропортах, на пристанях, причалах, железнодорожном транспорте, на воздушных и водных судах и иных объектах транспорта.
Дальневосточная транспортная прокуратура будет находиться в Хабаровске /подразделение во Владивостоке/, Западно-Сибирская - в Новосибирске /подразделениями - в Кемерово и Красноярске/, Восточно-Сибирская - в Иркутске /подразделения в Чите и Якутске/, Приволжская - в Нижнем Новгороде /подразделение в Самаре/, Уральская - в Екатеринбурге /подразделение в Челябинске/. Северо-Западная /Санкт-Петербург/ имеет подразделение в Ярославле, а Южная /Ростов-на-Дону/ - в Краснодаре и Саратове.
