На пост главы государства баллотировались два кандидата, выдвинутые депутатами правящей Партии коммунистов. Как заявил председатель специальной комиссии по проведению повторных выборов президента Молдавии Валерий Савва, за кандидатуру исполняющей обязанности премьер-министра страны Зинаиды Гречаной проголосовали все 60 депутатов-коммунистов, но для ее утверждения главой государства, как и в первом туре выборов, не хватило одного голоса. Кандидатура чрезвычайного и полномочного посла Молдавии в России Андрея Негуца не набрала ни одного голоса.
Для избрания президента необходимо было набрать 3/5 голосов от общего числа парламентариев, то есть как минимум 61 голос из 101. Однако представители оппозиционных партий (Либеральная, Либерально-демократическая партия Молдавии, альянс "Наша Молдавия"), которые в целом имеют 41 мандат, отказались принять участие в голосовании. Они ранее заявили о намерении блокировать выборы президента и добиваться тем самым досрочных парламентских выборов, считая выборы от 5 апреля 2009г. сфальсифицированными, а нынешний парламент - нелегитимным.