Целью функционирования сети является формирование в сфере нанотехнологий конкурентоспособного сектора исследований и разработок и эффективной системы коммерциализации объектов интеллектуальной собственности, а также создание условий для масштабного наращивания объема производства продукции наноиндустрии и выхода российских организаций на мировой рынок высоких технологий.
Основными составляющими нанотехнологической сети, обеспечивающими ее функционирование, являются: информационно-аналитическая система развития наноиндустрии (мониторинг, анализ, прогнозирование); информационно- коммуникационная система (информационное обеспечение функционирования национальной нанотехнологической сети); система мониторинга рынков продукции наноиндустрии и бизнес-планирования; система кадрового обеспечения наноиндустрии; система правового обеспечения деятельности участников национальной нанотехнологической сети; система метрологии, стандартизации и оценки соответствия.
Вхождение организации в состав национальной нанотехнологической сети осуществляется на добровольной основе. Органом управления и координации национальной нанотехнологической сети является Министерство образования и науки РФ.
