В Уральском государственном Владимир Третьяков работал с 1963 года, с 1993 по 2007 был ректором УрГУ. За свою карьеру опубликовал свыше 90 научных работ на темы, связанные с техникой, устойчивостью, стабилизацией и управлением динамическими системами.
Член-корреспондент Российской академии наук с 2000 года, за общественную деятельность удостоен званий «Почетный работник высшей школы» и «Почетный гражданин Екатеринбурга». Владимир Третьяков был одним из инициаторов объединения УГТУ-УПИ и УрГУ в единый вуз — УрФУ.
Причина смерти не уточняется.